Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms