Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpbP27048 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpbP27048 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms