Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CftrP26361 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CftrP26361 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CftrP26361 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CftrP26361 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CftrP26361 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CftrP26361 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CftrP26361 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CftrP26361 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CftrP26361 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CftrP26361 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CftrP26361 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CftrP26361 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CftrP26361 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CftrP26361 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CftrP26361 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CftrP26361 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CftrP26361 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CftrP26361 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CftrP26361 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CftrP26361 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CftrP26361 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CftrP26361 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CftrP26361 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CftrP26361 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CftrP26361 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CftrP26361 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CftrP26361 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CftrP26361 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CftrP26361 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CftrP26361 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CftrP26361 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CftrP26361 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CftrP26361 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CftrP26361 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CftrP26361 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CftrP26361 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CftrP26361 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CftrP26361 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CftrP26361 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CftrP26361 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CftrP26361 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CftrP26361 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CftrP26361 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CftrP26361 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CftrP26361 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CftrP26361 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CftrP26361 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CftrP26361 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CftrP26361 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CftrP26361 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CftrP26361 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CftrP26361 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CftrP26361 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CftrP26361 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CftrP26361 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CftrP26361 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CftrP26361 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CftrP26361 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CftrP26361 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CftrP26361 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CftrP26361 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CftrP26361 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CftrP26361 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CftrP26361 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CftrP26361 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CftrP26361 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CftrP26361 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CftrP26361 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CftrP26361 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CftrP26361 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CftrP26361 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CftrP26361 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CftrP26361 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CftrP26361 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CftrP26361 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CftrP26361 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CftrP26361 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CftrP26361 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CftrP26361 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CftrP26361 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CftrP26361 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CftrP26361 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CftrP26361 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CftrP26361 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms