Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChgaP26339 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChgaP26339 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChgaP26339 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChgaP26339 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms