Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccnd1P25322 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms