Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk11bP24788 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk11bP24788 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk11bP24788 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk11bP24788 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk11bP24788 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk11bP24788 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk11bP24788 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk11bP24788 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk11bP24788 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk11bP24788 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk11bP24788 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cdk11bP24788 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk11bP24788 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms