Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Hoxd11P23813 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms