Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZfaP23607 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZfaP23607 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms