Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkchP23298 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkchP23298 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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