Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja1P23242 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja1P23242 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja1P23242 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja1P23242 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja1P23242 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gja1P23242 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms