Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3aP23116 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms