Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RarbP22605 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RarbP22605 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RarbP22605 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RarbP22605 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RarbP22605 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RarbP22605 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RarbP22605 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RarbP22605 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RarbP22605 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RarbP22605 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RarbP22605 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RarbP22605 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RarbP22605 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RarbP22605 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RarbP22605 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RarbP22605 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RarbP22605 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RarbP22605 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RarbP22605 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RarbP22605 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RarbP22605 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RarbP22605 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RarbP22605 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RarbP22605 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RarbP22605 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RarbP22605 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RarbP22605 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RarbP22605 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RarbP22605 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RarbP22605 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RarbP22605 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RarbP22605 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RarbP22605 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RarbP22605 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RarbP22605 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RarbP22605 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RarbP22605 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RarbP22605 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RarbP22605 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RarbP22605 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RarbP22605 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RarbP22605 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RarbP22605 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RarbP22605 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RarbP22605 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RarbP22605 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RarbP22605 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RarbP22605 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RarbP22605 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RarbP22605 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RarbP22605 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RarbP22605 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RarbP22605 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RarbP22605 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RarbP22605 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RarbP22605 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RarbP22605 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RarbP22605 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RarbP22605 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RarbP22605 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RarbP22605 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RarbP22605 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RarbP22605 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RarbP22605 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RarbP22605 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RarbP22605 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RarbP22605 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RarbP22605 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RarbP22605 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RarbP22605 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RarbP22605 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RarbP22605 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RarbP22605 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RarbP22605 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RarbP22605 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RarbP22605 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RarbP22605 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RarbP22605 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RarbP22605 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RarbP22605 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RarbP22605 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RarbP22605 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RarbP22605 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RarbP22605 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RarbP22605 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RarbP22605 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RarbP22605 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RarbP22605 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RarbP22605 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RarbP22605 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RarbP22605 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RarbP22605 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RarbP22605 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RarbP22605 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RarbP22605 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RarbP22605 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RarbP22605 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RarbP22605 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RarbP22605 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms