Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms