Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox4i1P19783 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox4i1P19783 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms