Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms