Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka1P18653 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms