Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtpraP18052 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpraP18052 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtpraP18052 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms