Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms