Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf1P15314 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf1P15314 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms