Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fv4P11370 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fv4P11370 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms