Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lire1P11260 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lire1P11260 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms