Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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