Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms