Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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