Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NefmP08553 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NefmP08553 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NefmP08553 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NefmP08553 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NefmP08553 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefmP08553 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefmP08553 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefmP08553 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefmP08553 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefmP08553 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefmP08553 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefmP08553 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NefmP08553 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefmP08553 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefmP08553 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefmP08553 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefmP08553 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefmP08553 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefmP08553 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NefmP08553 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NefmP08553 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NefmP08553 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NefmP08553 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NefmP08553 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NefmP08553 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NefmP08553 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefmP08553 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefmP08553 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefmP08553 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefmP08553 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefmP08553 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefmP08553 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NefmP08553 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefmP08553 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefmP08553 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefmP08553 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefmP08553 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefmP08553 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefmP08553 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NefmP08553 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NefmP08553 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NefmP08553 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NefmP08553 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NefmP08553 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NefmP08553 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NefmP08553 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NefmP08553 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NefmP08553 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NefmP08553 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NefmP08553 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NefmP08553 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NefmP08553 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NefmP08553 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NefmP08553 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NefmP08553 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NefmP08553 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NefmP08553 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NefmP08553 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NefmP08553 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefmP08553 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefmP08553 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefmP08553 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefmP08553 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefmP08553 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefmP08553 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefmP08553 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefmP08553 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefmP08553 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefmP08553 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefmP08553 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefmP08553 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NefmP08553 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NefmP08553 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NefmP08553 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NefmP08553 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NefmP08553 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NefmP08553 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NefmP08553 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NefmP08553 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NefmP08553 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NefmP08553 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NefmP08553 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NefmP08553 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms