Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApoeP08226 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApoeP08226 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ApoeP08226 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApoeP08226 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ApoeP08226 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApoeP08226 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApoeP08226 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApoeP08226 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApoeP08226 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApoeP08226 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApoeP08226 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms