Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spta1P08032 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms