Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06344 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06344 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06344 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06344 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06344 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06344 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06344 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06344 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06344 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06344 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06344 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06344 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06344 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06344 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06344 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06344 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06344 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06344 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms