Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P06336 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06336 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06336 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06336 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06336 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06336 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06336 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06336 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
P06336 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06336 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06336 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms