Protein–RNA interactions for Protein: P03953

Cfd, Complement factor D, mousemouse

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfdP03953 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CfdP03953 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CfdP03953 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CfdP03953 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CfdP03953 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CfdP03953 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CfdP03953 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CfdP03953 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CfdP03953 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CfdP03953 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CfdP03953 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CfdP03953 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CfdP03953 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CfdP03953 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CfdP03953 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CfdP03953 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CfdP03953 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CfdP03953 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CfdP03953 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CfdP03953 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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