Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa7P02830 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxa7P02830 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxa7P02830 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxa7P02830 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxa7P02830 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa7P02830 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa7P02830 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa7P02830 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa7P02830 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa7P02830 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa7P02830 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa7P02830 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa7P02830 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms