Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01878 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01878 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01878 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01878 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01878 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01878 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01878 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01878 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01878 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01878 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01878 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01878 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01878 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01878 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01878 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01878 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01878 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01878 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01878 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01878 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01878 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01878 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01878 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01878 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01878 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01878 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01878 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01878 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01878 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01878 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01878 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01878 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01878 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01878 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01878 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01878 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01878 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01878 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01878 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01878 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01878 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01878 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01878 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01878 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01878 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01878 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01878 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01878 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01878 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01878 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01878 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01878 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01878 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01878 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01878 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01878 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01878 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01878 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01878 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01878 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01878 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01878 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01878 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01878 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01878 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01878 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01878 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01878 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01878 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms