Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01852 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01852 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01852 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01852 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01852 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01852 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01852 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
P01852 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01852 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01852 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01852 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01852 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01852 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01852 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01852 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01852 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01852 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01852 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01852 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01852 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms