Protein–RNA interactions for Protein: P01804

Ig heavy chain V-III region HPC76 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01804 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01804 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01804 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01804 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01804 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01804 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01804 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01804 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01804 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01804 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01804 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms