Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01746 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01746 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01746 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01746 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01746 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01746 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01746 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01746 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01746 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01746 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01746 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01746 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01746 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01746 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01746 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01746 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01746 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01746 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01746 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01746 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms