Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01678 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01678 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01678 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01678 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01678 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01678 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01678 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01678 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01678 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms