Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01655 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01655 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01655 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01655 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01655 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01655 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms