Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01648 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01648 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01648 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01648 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01648 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01648 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01648 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01648 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01648 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01648 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01648 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01648 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01648 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01648 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01648 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01648 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01648 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01648 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01648 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01648 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01648 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01648 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01648 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01648 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01648 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01648 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01648 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01648 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01648 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01648 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01648 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01648 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01648 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01648 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01648 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01648 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01648 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01648 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01648 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01648 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01648 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01648 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01648 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01648 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01648 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01648 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01648 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01648 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01648 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01648 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01648 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01648 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01648 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01648 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01648 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01648 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01648 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01648 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01648 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01648 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01648 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01648 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01648 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms