Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igk-V19-17P01633 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms