Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4bP01029 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4bP01029 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4bP01029 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4bP01029 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4bP01029 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4bP01029 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4bP01029 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4bP01029 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4bP01029 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4bP01029 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4bP01029 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C4bP01029 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4bP01029 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4bP01029 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4bP01029 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4bP01029 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4bP01029 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4bP01029 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4bP01029 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4bP01029 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4bP01029 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4bP01029 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4bP01029 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4bP01029 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C4bP01029 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4bP01029 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4bP01029 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4bP01029 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4bP01029 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4bP01029 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4bP01029 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4bP01029 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4bP01029 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4bP01029 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4bP01029 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4bP01029 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4bP01029 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4bP01029 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4bP01029 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4bP01029 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4bP01029 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4bP01029 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4bP01029 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4bP01029 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4bP01029 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C4bP01029 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C4bP01029 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4bP01029 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4bP01029 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4bP01029 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4bP01029 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4bP01029 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4bP01029 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4bP01029 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4bP01029 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C4bP01029 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C4bP01029 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C4bP01029 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4bP01029 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms