Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casp8O89110 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms