Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
F11rO88792 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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F11rO88792 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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F11rO88792 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
F11rO88792 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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F11rO88792 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
F11rO88792 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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F11rO88792 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
F11rO88792 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
F11rO88792 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
F11rO88792 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
F11rO88792 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
F11rO88792 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
F11rO88792 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
F11rO88792 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
F11rO88792 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
F11rO88792 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
F11rO88792 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
F11rO88792 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
F11rO88792 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
F11rO88792 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
F11rO88792 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
F11rO88792 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
F11rO88792 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
F11rO88792 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
F11rO88792 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
F11rO88792 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
F11rO88792 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F11rO88792 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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