Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1O88746 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1O88746 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1O88746 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1O88746 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1O88746 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tom1O88746 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tom1O88746 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tom1O88746 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tom1O88746 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tom1O88746 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tom1O88746 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tom1O88746 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms