Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BlmO88700 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BlmO88700 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BlmO88700 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BlmO88700 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BlmO88700 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BlmO88700 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BlmO88700 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BlmO88700 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BlmO88700 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BlmO88700 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BlmO88700 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BlmO88700 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BlmO88700 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BlmO88700 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BlmO88700 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BlmO88700 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BlmO88700 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BlmO88700 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BlmO88700 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BlmO88700 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BlmO88700 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BlmO88700 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BlmO88700 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BlmO88700 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BlmO88700 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BlmO88700 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BlmO88700 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BlmO88700 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BlmO88700 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BlmO88700 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BlmO88700 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BlmO88700 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BlmO88700 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BlmO88700 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BlmO88700 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BlmO88700 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BlmO88700 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BlmO88700 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BlmO88700 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BlmO88700 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BlmO88700 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BlmO88700 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BlmO88700 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BlmO88700 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BlmO88700 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BlmO88700 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BlmO88700 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BlmO88700 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BlmO88700 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BlmO88700 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BlmO88700 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BlmO88700 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BlmO88700 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BlmO88700 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BlmO88700 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BlmO88700 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BlmO88700 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BlmO88700 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BlmO88700 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BlmO88700 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BlmO88700 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BlmO88700 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BlmO88700 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BlmO88700 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BlmO88700 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BlmO88700 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BlmO88700 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BlmO88700 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BlmO88700 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BlmO88700 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BlmO88700 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BlmO88700 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BlmO88700 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BlmO88700 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BlmO88700 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BlmO88700 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BlmO88700 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BlmO88700 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BlmO88700 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BlmO88700 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BlmO88700 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BlmO88700 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BlmO88700 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BlmO88700 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms