Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ComtO88587 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ComtO88587 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ComtO88587 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ComtO88587 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ComtO88587 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ComtO88587 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ComtO88587 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ComtO88587 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ComtO88587 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ComtO88587 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ComtO88587 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ComtO88587 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ComtO88587 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ComtO88587 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ComtO88587 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ComtO88587 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ComtO88587 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ComtO88587 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ComtO88587 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ComtO88587 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ComtO88587 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ComtO88587 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ComtO88587 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ComtO88587 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ComtO88587 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ComtO88587 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ComtO88587 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ComtO88587 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ComtO88587 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ComtO88587 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ComtO88587 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ComtO88587 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ComtO88587 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ComtO88587 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ComtO88587 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ComtO88587 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ComtO88587 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ComtO88587 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ComtO88587 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ComtO88587 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ComtO88587 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ComtO88587 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ComtO88587 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ComtO88587 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ComtO88587 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ComtO88587 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ComtO88587 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ComtO88587 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ComtO88587 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ComtO88587 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ComtO88587 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ComtO88587 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ComtO88587 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ComtO88587 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ComtO88587 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ComtO88587 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ComtO88587 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ComtO88587 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ComtO88587 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms