Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops6O88545 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops6O88545 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cops6O88545 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cops6O88545 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops6O88545 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops6O88545 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cops6O88545 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cops6O88545 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops6O88545 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops6O88545 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops6O88545 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops6O88545 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops6O88545 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cops6O88545 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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