Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nid2O88322 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nid2O88322 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid2O88322 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid2O88322 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid2O88322 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid2O88322 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid2O88322 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nid2O88322 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nid2O88322 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nid2O88322 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nid2O88322 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nid2O88322 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nid2O88322 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nid2O88322 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nid2O88322 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nid2O88322 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms