Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms