Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CaskO70589 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CaskO70589 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CaskO70589 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CaskO70589 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CaskO70589 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CaskO70589 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CaskO70589 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CaskO70589 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CaskO70589 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CaskO70589 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CaskO70589 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CaskO70589 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CaskO70589 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaskO70589 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaskO70589 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms