Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgceO70258 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgceO70258 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgceO70258 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgceO70258 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgceO70258 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgceO70258 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgceO70258 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SgceO70258 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgceO70258 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgceO70258 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgceO70258 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgceO70258 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgceO70258 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgceO70258 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgceO70258 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgceO70258 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgceO70258 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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